No topo da Pedra Bonita existiam duas torres metálicas de microondas com 10 metros de altura. Uma pertencia a EMBRATEL e a outra a TELERJ. Uma terceira, da TV GLobo, estava sendo construída sobre uma estrutura abandonada desde a Eco-92, mas foi embargada. A construção desta terceira torre mostra que o local é estratégico para a colocação de torres para diversos fins. Mas a Pedra Bonita não deve ser transformada em outro Sumaré. Seria o fim do uso público de um dos mais bonitos locais da cidade. Até hoje, não se sabe ao certo se as torres oferecem riscos a saúde do visitante por causa das microondas. O certo é que é comum as pessoas subirem nelas, colocando em risco suas vidas. Uma das torres não oferecia nenhuma proteção contra a invasão, sendo a mais usada para brincadeiras.

O Terra Brasil vinha mantendo conversações com o Parque no sentido de regularizar a situação das torres na Pedra Bonita. Foi solicitada a EMBRATEL a retirada de sua torre (já sem função), sendo prontamente feito o desmonte da estrutura e sua retirada, sem que houvessem danos ao meio ambiente. Dessa forma, começa a atuação na Pedra Bonita da nova Chefia do Parque.

Em 2002, as 3 torres foram retiradas sem danos a Pedra Bonita.